A intolerância alimentar é uma reação anómala a determinados alimentos (não relacionada com a toxicidade), que afeta a atividade normal em indivíduos suscetíveis.
A diferença entre as reações alérgicas imediatas e as intolerâncias alimentares é que estas últimas são mais difíceis de detetar, uma vez que não apresentam reação causa-efeito imediata (a reação ocorre entre 8 a 72 horas depois).
Estima-se que aproximadamente 20-35% da população sofra de intolerância alimentar crónica a determinados alimentos. A supressão destes alimentos aos quais o indivíduo apresenta hipersensibilidade alimentar proporciona uma melhoria significativa na sua sintomatologia. Os alimentos podem voltar a ser inseridos na dieta, de forma gradual, após 6 meses.